一、 代码的所有权。
小程序的自定义开发可以让企业拥有小程序100%的代码所有权。无论是小程序开发还是应用程序开发，一旦定制开发完成，这个项目的源代码所有权必须属于这家公司。这样，如果企业未来有新的需求，就可以自行修改小程序的代码，而不受第三方控制。例如，如果原管理员权限、一些设计变更和企业未来的新发展，小程序的功能可以扩展或删除。如果小程序是由模板创建的，一般是没有办法改变的，或者你需要支付更多的费用请第三方修改。
二、 以满足不同企业的需求。
小程序定制可以更好的满足企业真实的业务需求，定制小程序开发与软件开发是差不多的，首先就需要非常详细地、全面的对企业的真实需求进行了解，按照公司的项目定位、项目开发计划和项目开发流程来制定出详细的开发流程，接着让客户对经过整理之后的开发方案进行确认，例如看需求计划和原型图是不是满足小程序定制开发的理念，从而开始进行下一阶段的定制化开发，基于原型图迭代开发和更新小程序。因此，小程序的定制开发可以最大程度地满足企业客户的开发要求。模板开发的小程序通常提供某些行业的共同需求，不能根据每个企业的不同需求进行开发。
三、更安全、更可靠。
为小程序定制的服务器独立存在，用于存储小程序代码、用户数据和一些重要文档。模板applet只提供了一个用户Account来登录，服务器是所有人都使用的。这样一来，企业的一些重要用户数据等非常敏感的数据就会完全暴露给小程序模板开发公司，构成了非常严重的安全问题。
四、 试错的成本并不高。
小程序定制的另一个好处是，它可以大大降低公司在互联网之上的试错成本。如果你开发一个应用程序，试错的成本可能是几万，甚至几十万。且如果是小程序，它的试错成本不到应用程序的十分之一，所以对于一些小规模的企业来说，不会造成太大的损失。
总之，自定义开发小程序有很多优势，因此将成为小程序开发的主流方法，并得到商家的认可。
